嘉峪关城市博物馆现设“五部一室”,即社会教育部、收藏研究部、综合管理部、安全保卫部、游客服务部和办公室。现有在编正式职工12人,辅助岗位用工11人,旅游基层1人,公益性岗位1人。其中,本科及以上学历人员18人,占总人数的72%。专业技术人员6人,其中,中级职称1人,初级职称5人。